新型冠狀病毒從去年（2020年）延燒至今，台灣截至今天（04月28日）國內累計20萬4833例新型冠狀病毒相關通報（含20萬2612例排除），確診個案中12人死亡、1050人解除隔離、48人住院隔離。最近的案例中，航空公司也受到了不少波及，華航目前累計9名機師與1名家屬染疫，染疫案不斷延燒。指揮中心調查確診者在台行程發現，04月20日公佈確診的澳洲籍華航機師，曾於04月16日前往台北清真寺參加活動，當時有65位台科大師生在場。
台科大在04月27日宣佈，由於國際處清查，校內有65位師生曾於4月16日參加臺北清真寺活動，學校在04月23日隨即通知上述師生加強自主健康管理至04月30日，且不得進入校園。因應05月01日、05月02日校內舉辦四技二專統測，為讓考生能安心應考，學校在04月25日已經進行全校大消毒。不影響師生權益下，從04月27日開始，全校各系所到05月03日全面改採遠距授課方式（05月04日恢復實體授課）。
除了台科大以外，04月16日台北清真寺活動，台北科技大學、政治大學、銘傳大學皆有學生參加，校方已要求自主健康管理至04月30日。台大經調查後宣佈，當日有11名學生及1名職員參加，而台師大也有3名學生在場。由於台大、台師大、台科大為台大系統，台大表示，若有跨校選台大或台科大課程的學生，須配合台科大遠距上課至05月03日，台師大則維持正常上課模式。指揮中心針對近期清真寺爆發疫情的狀況，研擬日後宗教場所應納入實名制，以便疫調，確保台灣疫情的維持。
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