公園處自105年起推動公園生態化，挑選了12座公園進行公園環境改善及棲地復育的工作，一方面以去水泥化及增加綠覆蓋率等方式營造生態友善環境，一方面推動分區管理減少不必要的人為干擾，整個過程並持續與關心生態環境的非政府組織團體(NGO)互動、合作，希望在都會公園設立生態保育的示範區、並藉由環境保育、招募生態志工與舉辦宣導活動，鼓勵社區參與，逐步提升在地民眾成為支持公園生態環境保育的力量。
公園生態化的分區管理，係參考國家公園法，將公園內依區域特性(生態維護需要、空間利用特性)劃設以下區域；生態維護區、緩衝區、一般休憩區，並分別依其差異性擬定開放原則、營造原則、管理規範(修剪割草等植栽管理、植栽種植、增設硬體設施、環境維護等)等，藉由這項措施的推動，可以減少民眾的活動行為干擾、減少管理機關的維護行為干擾，並可適當維持自然特性，避免開發利用。
分區管理的規劃過程，公園處與合作的NGO團體討論，依據公園內需要維護的棲地環境、需要保護的物種棲息範圍及現況開放民眾遊憩範圍等，界定各公園內生態豐富區域，並視需要增設緩衝區，與完全開放民眾遊憩使用的一般休憩區有所區隔，並以綠籬、木圍籬等方式形成邊界，在重要的出入口設置分區管理告示牌，除了以分區平面圖標示閱覽者所在位置，並說明分區管理規定提醒民眾配合事項，此外也已配合雙語化，讓遊憩的外籍人士也能知悉分區管理的現況，並共同遵守維護環境。
目前已完成6座公園的分區管理，包括前年(110)的大安森林公園、木柵公園、榮星花園公園，去年(111)的富陽自然生態公園、永春埤生態濕地公園、大湖公園，今年將持續推動士林官邸公園、崇仰公園及南港公園的分區管理規劃，呼籲在公園處規劃設置完成後，大家能夠依同遵守支持相關的管理規定，不要擅自進出生態維護區從事活動，也不要在公園範圍內任意放生、放養、捕捉生物，或栽種、破壞植栽，共同維護都會公園良好的生態環境。
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